在原核与真核两大表达系统中,重组蛋白的生产均绕不开一个关键环节——菌种(细胞)建库。目前,针对真核细胞和原核细胞的细胞建库,其命名体系和整体构建流程在逻辑上是基本一致的,均遵循从RCB(Research Cell Bank,研究细胞库) 到MCB(Master Cell Bank,主细胞库),再到WCB(Working Cell Bank,工作细胞库) 的逐级放大路径。
然而,两者之间最核心的差异在于构建方式——这直接决定了实验路径、周期和工艺控制策略的不同。接下来,菌菌将重点围绕原核细胞建库的全流程展开详细解读,同时穿插与真核体系的对比,帮助大家建立清晰的认知框架。
一、原核细胞库构建的基本认知
在进行原核细胞库构建之前,首先需要明确细胞库构建的最终目的——无论是用于蛋白表达筛选、工艺开发,还是未来申报生产,这一目标将直接影响后续实验方案的设计。
确定目的后,第一步便是开展RCB菌株细胞的构建。RCB是整个细胞库体系的“源头”,其质量决定了后续MCB和WCB的天花板。因此,在RCB阶段,必须对菌株进行表达水平验证,全面考察其各项指标是否满足预设的质量标准,从而为后续MCB和WCB的建立奠定坚实基础。
细胞库系统通常由两个核心层级构成:
・主细胞库(MCB):由含目的基因表达载体转化的细胞种子,经传代扩增后制备成均一悬液,定量分装于单独容器中用于长期贮存。MCB是细胞库体系的核心批次,所有工作细胞库均来源于此。
・工作细胞库(WCB):从主细胞库中取出一支或多支,经有限传代扩增后制成的均一悬液,同样分装于单独容器中用于日常生产使用。
需要特别强调的是,所有贮藏容器均应在相同且受控的条件下妥善保管,一旦取出使用,不得再返回库内保存,以防交叉污染和冻融风险。
星耀小TIP:
应详细记录细胞库的类型、容量、预期使用频率下的寿命、保存容器、冻存剂配方、培养基信息、冷冻保存步骤及贮存条件等关键信息,并需提供库存细胞在拟贮存条件下的稳定性证据,这是合规性检查的重要一环。
二、原核细胞库的详细构建流程
在原核细胞库的构建中,RCB细胞库的构建是最为关键的环节,也是整个建库工作的技术起点。
2.1/法规对RCB的基本定位
法规层面要求“建立RCB需保证可溯源性”,同时对实验室阶段较为友好——GMP体系下生产对RCB来说为非必须条件。这意味着RCB构建可以在研发实验室完成,但需确保全过程记录完整、数据可追溯。
2.2/RCB构建的“三步走”流程
第一步:重组质粒的构建与验证。
首先将目标基因通过PCR实验进行扩增,再利用酶切连接技术将扩增产物构建至表达载体中,得到重组质粒。随后须经过酶切验证、PCR验证、测序验证,以及蛋白表达验证,在确认序列正确且蛋白表达无误后,方可认为质粒构建成功。(质粒构建流程图参见图1)

图1 质粒构建流程图
第二步:感受态细胞的制备。
在耀海生物公众号的相关文章《【菌周刊】大肠杆菌DH5α感受态细胞的制备》和《【菌周刊】大肠杆菌Red同源重组敲除—感受态细胞的制备》中,均有具体实验流程可供参考。(参见图2)

图2 CaCl2法制备感受态细胞
星耀小TIP:
需特别留意的是,CaCl₂法所制备的大肠杆菌感受态细胞,对温度和保存时间极为敏感,转化率易受多重因素影响。实际操作中,新鲜制备的感受态细胞往往还需经过甘油处理、液氮速冻及超低温保存等复杂环节,这不仅增加了样品处理步骤,还须购置昂贵的超低温设备,既推高实验成本、延长操作周期,也可能引入转化污染的风险。因此,选择合适的感受态细胞制备方案与保存条件至关重要。
第三步:转化、筛选与RCB建库。
将验证正确的重组质粒与感受态细胞一同转化入宿主细胞(常用大肠杆菌)中。转化后,从原始菌株中筛选出优势菌株,制备宿主甘油菌。按一定比例接种于含抗生素的筛选培养基中,进行菌株筛选与扩增培养,常用方式为平板划线法。从中挑选长势良好的优势单菌落,进行甘油分装并保藏,通常建议建立50~100支菌株作为RCB细胞库。
建库完成后,须同步进行表达水平验证,确保RCB中的优势菌株在表达量、产物质量等方面均符合实验要求。得到的菌种液根据实验目的收集上清液或菌体沉淀——若目的产物分泌至上清液中,可使用AKTA层析系统,通过亲和层析、分子筛层析、离子交换层析等方式纯化获得目标样品并交付。(RCB菌株库流程图参见图3)

图3 RCB菌株库流程图
三、MCB与WCB的法规要求与操作规范
MCB和WCB的建立须严格参照《中国药典》2020年版三部相关要求执行:
・MCB:取RCB库中的菌种,通过规定方式传代增殖后,在特定倍增水平或传代水平同次均匀混合成一批,定量分装,保存于-60 ℃及以下的环境中。该批菌种须按特定质控要求进行全面检定,全部合格后方可作为主细胞库使用,并以此供应后续工作细胞库的建立。
・WCB:从主细胞库中取菌种传代增殖,达到一定代次水平后,合并制成一批均质细胞悬液,定量分装于安瓿或适宜的菌种冻存管中,在-60 °C及以下的甘油管中保存备用。
星耀小TIP:
依据《中国药典》2020年版三部规定,生产企业的主细胞库最多不得超过两个细胞代次,工作细胞库必须限定为一个细胞代次。同时,MCB和WCB的构建必须在GMP车间内完成,这是进入临床及商业化阶段的硬性门槛。
四、结语
回顾本次的核心内容:真核细胞与原核细胞的建库流程,其命名体系和逻辑框架高度一致,均遵循RCB→MCB→WCB的三级体系;核心差异在于构建方式——原核细胞主要依赖质粒DNA与感受态细胞的化学转化法导入宿主(常用大肠杆菌),而真核细胞则需通过转染、稳定整合及单克隆筛选等更为复杂的路径。
在原核细胞建库中,RCB建库是承上启下的重中之重,其菌株的稳定性与表达水平,直接决定了后续MCB和WCB的成败。无论是原核还是真核体系,严谨的建库策略、规范的记录溯源、严格的代次控制,始终是保证产品质量和合规性的基石。
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